Los programas de desarrollo rural 2007-2013 financiados por FEADER incluyen medidas de ayuda directa a los agricultores, tales como las ayudas agroambientales, las indemnizaciones en zonas desfavorecidas, las ayudas para bienestar animal o las ayudas para terrenos agrarios incluidos en la Red Natura 2000.

Como se indicó en las ponencias presentadas en una jornada sobre el «chequeo médico» organizada recientemente por la Confederación de Cooperativas Agrarias de España, estas ayudas directas tienen una gran importancia económica, superando los 8.000 millones de euros anuales en la UE. En España se acercan a los 450 millones de euros.