El Ministerio de Agricultura (MAPA) ya ha presentado a la Comisión Europea su programa de erradicación de tuberculosis bovina para 2006. El objetivo del mismo es continuar con la sectorización, tanto por aptitud productiva como por Comunidades Autónomas, en función de la prevalencia de la enfermedad. Se diferencian dos subpoblaciones: bovino de aptitud lechera y bovino de aptitud cárnica.

En el bovino de leche, el objetivo es alcanzar la eliminación de la enfermedad en un año.

En el bovino de carne, se han realizado tres subdivisiones en función de prevalencia distinta:

a) Comunidades Autónomas con un rango de prevalencia de rebaño inferior a 1%: El objetivo es alcanzar un nivel de prevalencia de rebaño por debajo de 0,2% en un período de un año, en aquellas CCAA cuya prevalencia en el año 2004 ha sido inferior a 1%.

b) Comunidades Autónomas con un rango de prevalencia de rebaño superior al 1% e inferior al 5%: El objetivo es disminuir la prevalencia de rebaño por debajo del 1% en un año para las CCAA cuya prevalencia en el año 2004 se situó entre el 1% y 5%.

c) Comunidades Autónomas con un rango de prevalencia de rebaño superior al 5% e inferior al 10%: El objetivo es reducir la prevalencia de rebaño por debajo del 2% en un año para las CCAA cuya prevalencia en el año 2004 se situó entre 5 y 10%.